天才脑科学家白月魁为救恩师霍恩进行了脑移植术，却不想霍恩受到西弗残存意识的影响......琼斯盗取了天使再生剂注射到19号实验体上引起了一系列异变。同一时间，久川市因为瘟疫感染变成了一片人间炼狱，市长白靖宇和人工智能ASH为了抵御联盟的入侵誓死不降，却不想等到一切尘埃落定之时，真正的末日却来临了……
I-Machine——那是在极限环境下作业的大型机器人的总称。 联盟学院学生三栗麻耶在使用I-Machine的途中被卷入事故， 得到驾驶着I-Machine、如同海贼一般挖掘欧利哈特矿石的埃斯卡维特公
东国少年“梵天”执行秘密任务，来到中原国，遇到海难失去部分记忆。梵天被腿疾少女“公良潸”所救。梵天为报答救命之恩，答应“虹引”师太的请求，带潸儿和镇观奇书，下山寻找书中记载的仙岛，医治潸儿的腿疾，途径
